IdentityX
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IdentityX 紹介:
IdentityX は配列をアライメントした状態で保存し、配列の Identity を数えるために開発した Macintosh 専用のアプリケーションです。
ClustalW2、シークエンスの生データのアライメントに適した「アライメント」、分子量の計算、ORFの検索、塩基配列を編集しながらアミノ酸配列を見ることのできる「Amino view」、波形ファイルを表示する「Wave view」、樹形図を表示する 「Tree view」、全体像を把握するための「Over view」、 Dot blot 、 Degenerate primer の設計、 GC 含量や疎水性の程度を表す「プロット」など、生物学で使う機能も多彩です。
さらに通常の「or 検索」だけでなく、一致率を指定したあいまいな検索や、二つの条件を満たしたもののみ検索する「and 検索」、検索語の末端だけを検索対象とする「末端検索」、複数の検索語をまとめて or 検索する「ぐるっぱ検索」など他のソフトでは見られない高度な検索が可能です。
IdentityX には TEXT モードと BOX モードがあります。 TEXT モードは配列の編集を行うときに使用します。 BOX モードは Identity を数える範囲を指定するときに使用します。また、BOX にはコメントも付加できるので、メモ代わりにも使えます。